Το φαινόμενο του υπερτουρισμού, που έχει ήδη προκαλέσει αντιδράσεις σε δημοφιλείς προορισμούς όπως η Σαντορίνη, η Βαρκελώνη ή το Άμστερνταμ, φαίνεται πως αγγίζει πλέον και μικρότερους ελληνικούς προορισμούς όπως τα Κουφονήσια.
Επισκέπτες αναφέρουν πως η αίσθηση της ηρεμίας και της «απομόνωσης» που χαρακτήριζε το νησί έχει αρχίσει να χάνεται, καθώς η συνεχής τουριστική προβολή και η έλλειψη υποδομών οδηγούν σε κορεσμό. Οι παραλίες, οι ταβέρνες και τα καταλύματα λειτουργούν πλέον στα όριά τους, ενώ οι ντόπιοι δυσκολεύονται να εξυπηρετήσουν τον ολοένα αυξανόμενο αριθμό επισκεπτών.
Το Κουφονήσι, που κάποτε ήταν συνώνυμο της απλότητας και της ανεπιτήδευτης φιλοξενίας, παλεύει να ισορροπήσει ανάμεσα στην αυξανόμενη τουριστική ζήτηση και τη διατήρηση της αυθεντικότητας του τόπου.
Ειδικοί προειδοποιούν πως, αν δεν υπάρξει στρατηγικός σχεδιασμός για τον τουρισμό μικρής κλίμακας, περιοχές σαν τα Κουφονήσια κινδυνεύουν να αλλοιωθούν πλήρως, χάνοντας το βασικό στοιχείο που τις έκανε αρχικά ελκυστικές: την αίσθηση του ανεπιτήδευτου και την επαφή με τη φύση.
